九三学社前身为抗日战争后期一批进步学者发扬五四运动反帝反封建的爱国精神，以民主、科学为宗旨，在重庆组织的“民主科学座谈会”，后为纪念1945年9月3日抗日战争和世界反法西斯战争的伟大胜利，改建为九三学社。

1995年12月成立九三学社南海小组，隶属佛山市第三支社。1997年1月成立九三学社南海支社。 2003年5月成立九三学社南海基层委员会，下设四个支社。基层委员会是科技界中、高级知识分子为主的组织，其整体的先进性、代表性是每个社员在岗业绩来体现的。

九三学社南海基层委员会现有社员113人，大专以上学历109人，高中级职称69人，下设一支社，二支社，三支社，四支社。现任主委金铎，副主委彭旺初、张梦阳、刘一军，总支委员有戴国梁、司建荣、邓华明、黄朝阳等四人。

2015年，在南海区民主党派专项调研资金项目中，九三学社南海基层委员会申报的《关于“三大湖”区域特色发展与建设品质南海的调研》、《关于依托创新创业载体，大力推动产学研合作，促进驻区高校、科技园、企业三方联运和科技成果就地转化的建议》、《关于以市场机制促进我区金融、科技、产业融合大发展的建议》、《坚持用法治思维来化解南海村居基层矛盾的对策》4个项目，分别获得1万、1.8万、1.3万和1万元的资金扶持。是年，九三学社南海基层委员会及成员向区政协递交提案27件，其中优秀提案6件：《关于实施主动城市化战略，构建南海大招商格局的建议》等。